La mission de BSAG est d'accélérer le sauvetage écologique de la mer Baltique en provoquant des changements systémiques. Leurs principaux objectifs sont :
- Lutter contre l'eutrophisation : Réduire l'apport de nutriments (comme le phosphore et l'azote) provenant de l'agriculture et de la navigation.
- Agriculture régénératrice : Transformer le secteur agricole en formant les agriculteurs aux techniques qui restaurent la santé des sols et stockent le CO₂.
- Protection de la biodiversité marine : Créer et maintenir des zones marines protégées pour donner aux écosystèmes vulnérables la chance de se rétablir.
- Navigation durable : Encourager le secteur maritime à ne plus déverser les eaux usées et les substances nocives en mer.